Si no es posible reiniciar el servicio por ese error, este comando permite aumentar el numero de conexiones para acceder y pararlo.
gdb -p `cat /var/run/mysqld/mysqld.pid` -ex "set max_connections=1000" -batch
Fuente: http://dmnet.bitacoras.com/archivos/software/acceder-a-mysql-con-un-too-many-connections.php
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